入れ替わって初めて僕は君の好きに触れた

相思相愛である事に気づいていない二人、宮城 余市（みやぎ よいち）と山崎 碧（やまざき あおい）
二人が日直の時に、先生に書類を職員室へ運ぶよう指示されるが、
その際に階段から転げ落ちてしまう。
なんと、その時の衝撃で二人の身体が入れ替わってしまう！

その後、二人は入れ替わった事を周囲に黙ったまま生活をする。
そして入れ替わり生活をしているうちに、相思相愛であったことに互いが気付く。
しかし、二人はそこに触れることもなく月日が流れていく……。

そんなある日、碧の友人の角 響（すみ ひびき）が、宮城 余市を好きになり告白したいと
碧になった余市に相談する。
話の流れから、余市は碧に放課後屋上へ来るように呼び出す事になるが……